Teknik adamlık kariyerine Horsens’de başlayan Mogensen, Skanderborg, Aarhus, Byasen, Kobenhavn takımlarını çalıştırdı. Mogensen, 2016 yılından bu yana Kobenhavn’ı çalıştırıyordu. Sporculuk kariyerinde Avrupa Hentbol Federasyonu Kupası’nı kaldıran Mogensen; teknik adamlık kariyerinde ise Byasen ile –eski adıyla- Avrupa Kupa Galipleri Kupası’nda yarı final ve çeyrek final başarıları yakaladı. Danimarkalı çalıştırıcı Norveç’te iki kez yılın antrenörü seçildi. ClausMogensen, Kastamonu Belediyespor’daki ikinci Danimarkalı antrenör olacak. Daha önce Danimarkalı Antrenör Helle Thomsen da Kastamonu Belediyespor’u çalıştırmıştı.Kastamonu Belediyespor 2021-2022 sezonuna Rumen Antrenör CosticaBuceschi ile başlamış ardından Hakan Günal’ı takımın başına getirmiş ve son olarak takım kaptanı Serpil İskenderoğlu’na teknik sorumlu görevi vermiş ve sezonu bu şekilde tamamlamıştı.