2018 yılında Koç Üniversitesi Tıp Fakültesi'nden mezun olan Karabacakoğlu, Silopi Devlet Hastanesinde pratisyen hekim olarak göreve başladı. 2019-2024 yıllarında İzmir Tepecik Eğitim ve Araştırma Hastanesinde Asistan Doktor olarak görev yapan Op. Dr. Burak Karabacakoğlu, 2024 Kasım ayı itibariyle Kastamonu Eğitim Araştırma Hastanesi'nde Üroloji doktoru olarak görev yapıyor.